Det 15. århundrede markerede begyndelsen på portugisisk maleri . I 1428 ankom Jan van Eyck til Portugal gennem ægteskabet mellem Isabel, datter af kong Johan 1., og Filip den Gode, hertug af Burgund.
Det var begyndelsen på et langt og tæt forhold til Flandern, som påvirkede portugisisk maleri.
Fra flamenco erhvervede portugisiske kunstnere ikke kun viden om teknik og komposition, men også to traditioner for maleri, som voksede i betydning: religiøst maleri og portræt.
Disse to tendenser er tydeligt til stede i mesterværket af portugisisk kunst fra det 15. århundrede, nemlig Nunos paneler af Sankt Vincents tilbedelse, der er udstillet på det tidligere Lissabons kunstmuseum. Han blev udnævnt til hofmaler for Kong Afonso V i 1450, og panelerne blev malet mellem 1458 og 1464.
En malerskole kaldet den Nordlige Skole blev etableret omkring højdepunktet af den manuelinske arkitektur i det 16. århundrede. En bemærkelsesværdig maler i denne stil, der anvendte naturalisme og detaljerede baggrundslandskaber, var Vasco Fernandes, også kendt som 'Grão Vasco'.
Omkring samme tid var der en anden gruppe kendt som Lissabon-skolen, der producerede flere førsteklasses malere, herunder Jorge Afonso, Cristovão de Figueiredo, Fernandes Garcio og Gregório Lopes, en af ​​de mest kendte kunstnere i slutningen af ​​det 16. århundrede.
En af de mest berømte malere i portugisisk historie var Amadeo de Souza Cardoso (1887-1918), hvoraf nogle af værkerne kan ses i den nordlige by Amarante.